J. Cheminform. | 蛋白-蛋白(PPI)界面感知的分子生成框架用于PPI调节剂设计

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DRUG AI 蛋白–蛋白相互作用（PPIs）在众多生化和生物学过程中扮演着至关重要的角色。尽管已有多种基于结构的分子生成模型问世，PPI界面及其靶向化合物相较于传统的结合位点和小分子药物却表现出独特的物理化学性质。因此，针对PPI界面，特别是考虑PPI复合物或界面热点残基设计有效的靶向化合物，依然是一项重大挑战。2024年12月20日发表在 Journal of Cheminformatics 的研究论文《 Interface-aware molecular generative framework for protein–protein interaction modulators 》提出了一种全新的基于结构的分子生成框架，专门用于靶向PPI界面的分子设计。这项研究中，研究人员构建了一个涵盖活性和非活性化合物与PPI界面数据对的综合数据集。基于此数据集，提出了面向PPI界面的分子生成框架，命名为 GENiPPI。研究结果显示，GENiPPI 能够捕捉PPI界面与活性分子之间的潜在关系 ………………………………