医学博士,R语言及Python爱好者,科研方向为真实世界研究,生信分析与人工智能研究。
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生存分析机器学习模型解释的一揽子解决方案-survex包(三)自定义解释器

灵活胖子的科研进步之路  · 公众号  ·  · 2024-08-01 00:35

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survex 包致力于包含尽可能多的生存模型的自动创建解释器的功能。然而,由于可用包和模型的多样性,不可能全部包含。我们提供了手动为任何生存模型创建解释器的功能。 自动解释器创建 在最好的情况下,已经实现了为您想要的模型创建解释器。这意味着一切都可以从模型对象中提取(有时需要设置额外参数)。例如,这是 survival 包中比例风险模型的情况: library(survex) library(survival) cph auto_cph_explainer  自动创建学习器-coxph "可以看到, explain() 函数的唯一必需参数是比例风险模型本身。但是,在创建模型时,我们需要设置 model = TRUE,x = TRUE 。如果您忘记设置这些参数,则会显示错误。 手动创建解释器 下一个基本情况是使用所需模型可以进行所有类型的预测。然后可以使用 explain_survival() 函数手动创建解释器。让我们看一个例子-如何手动设 ………………………………

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