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NAR | 中国科学院靳文菲团队研究开发了scMMO-atlas:单细胞多模态组学图谱和探索精细细胞异质性和细胞动力学的门户

单细胞测序网  · 公众号  ·  · 2024-10-05 08:31
    

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导语 单细胞多模态测序同时捕获同一细胞的多个模态,提供了对细胞异质性和细胞动力学的无与伦比的见解。例如,来自同一单细胞(scATAC+RNA)的染色质可及性和转录组的联合分析在定义明确的集群中发现了新的细胞亚群。然而,单细胞多模态组学(scMMO)数据库的缺乏导致数据碎片化,严重阻碍了scMMO数据的访问、利用和挖掘。 单细胞测序网讯: 2024年9月24日,中国科学院靳文菲团队在 Nucleic Acids Research 在线发表题为 “scMMO-atlas: a single cell multimodal omics atlas and portal for exploring fine cell heterogeneity and cell dynamics” 的研究论文,该研究通过收集和整合各种scMMO数据来构建scMMO地图集,然后构建scMMO数据库和门户网站scMMO-atlas。 scMMO-atlas包括scATAC+RNA、scRNA+蛋白、scATAC+蛋白和scTri-modal组学数据,来自27个细胞组织/器官的3 168 824个细胞。scMMO-atlas提供了一个交互式的 ………………………………

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