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DP还能干这个?见刊《PNAS》,DeePMD助力探究磷酸酯键形成的微观机理

深度势能  · 公众号  ·  · 2024-06-24 18:36

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近日,法国国家科学研究中心Guillaume Stirnemann研究员及其团队成员,通过理论计算成功揭示了磷酸酯键形成的微观反应机理。该团队通过DeePMD方法结合增强采样构建神经网络势函数,实现了在显示溶剂条件下,对复杂化学反应数百纳秒的量子力学精度模拟,解释了磷酸酯键的形成,为设计更有效的非生物催化剂铺平了道路。相关研究成果以"Prebiotic chemical reactivity in solution with quantum accuracy and microsecond sampling using neural network potentials"为题,发表在国际学术杂志《PNAS》上。 研究背景 在生命的化学构成中,磷元素虽然含量不高,却扮演着至关重要的角色。它是核酸和脂质的重要组成部分,参与蛋白质的调控修饰,还通过二磷酸盐和三磷酸盐的平衡调节生物体内能量的存储与释放。然而,磷-氧键的形成异常困难,这种稳定性虽然保证了DNA的长期存在和细 ………………………………

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