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STOTEN | 厦门大学严重玲教授研究团队:18S rRNA基因V4和V9高可变区在鉴别河水不同粒径微生物上的表现差异

生态与地理速报  · 公众号  ·  · 2024-09-16 16:42

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河流在地球生态系统中扮演着至关重要的角色,而不同粒径的真核微生物是维持这河流生态系统健康的关键。真核微生物,包括单细胞藻类和原生动物,是河流生态系统中的基础生产者和营养循环的关键参与者。18S rRNA基因的V4和V9高可变区域是识别和分类真核微生物的常用分子标记。由于18S rRNA基因不同区域的测序覆盖范围存在差异,使用不同引物进行扩增子测序可能导致物种多样性和丰度估计的不一致。因此,精确鉴定和定量这些微生物对于深入理解生态过程具有重要意义。近期,厦门大学严重玲教授研究团队,选择了福建省的三条典型河流,对不同大小的真核微生物进行了采样和分析,通过对V4和V9扩增子测序比较,评估不同高可变区域在识别微生物多样性方面的效果。 研究发现,V9区域在分析真核微生物群落多样性方面表现更佳,扩增子测序 ………………………………

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