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引言 ❝ 借助 circlize 把多个 GSEA 富集通路使用环形图进行展示， ci rcGs ea 函数封装在 GseaVis 中。 安装 # install.packages("devtools") devtools::install_github( "junjunlab/GseaVis" ) 使用示例 先富集分析： library (ggplot2) library (org.Hs.eg.db) library (clusterProfiler) library (dplyr) library (GseaVis) # load test data data(geneList, package= "DOSE" ) gse ont = "BP" , keyType = "ENTREZID" , OrgDb = org.Hs.eg.db) gse "ENTREZID") df_gse geneSetID 5) 然后拿这个对象来绘图： circGsea(object = gse, geneSetID = geneSetID) 修改通路形式： circGsea(object = gse, geneSetID = geneSetID, GoIDfacing = "bending.inside" ) 添加通路名称： circGsea(object = gse, geneSetID = geneSetID, addDescription = T ) 调整一下距离： circG
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