Nat. Commun. | 基于深度学习方法评估RNA-蛋白复合物的类天然结构

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今天为大家介绍的是来自 Nature Communication 的一篇关于通过深度学习方法来评估 RNA- 蛋白质复合物类原生结构的文章。本文提出一种新的 RNA- 蛋白质复合物评分函数—— DRPScore ，该方法明确考虑结构灵活性。使用基于物理的模拟来生成训练诱饵，用于训练评分函数，并在 RNA- 蛋白质测试集上对 DRPScore 进行广泛评估。 1 介绍 如今已经开发了几种计算方法来评估 RNA- 蛋白质结构，这些方法可以分为基于倾向的统计评分函数和原子级的统计评分函数。基于倾向的评分函数统计分析了成对核苷酸 - 残基的接口倾向，基于玻尔兹曼逆公式构建了势统计公式。例如， DARS-RNP24 是 Tuszynska 和 Bujnicki 引入的一种粗粒度的基于倾向的评分函数， DARS-RNP24 通过四个项构建了评分函数：空间冲突惩罚和对距离、角度和位置的依赖性。随后， Xiao 等人以核苷酸 - 残基对的构 ………………………………