甲基化测序，究竟如何创新？

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DNA 甲基化是表观遗传学的重要内容之一，DNA 甲基化测序方法中最重要且经典的一种方法即 重亚硫酸盐测序。 图：亚硫酸氢盐测序的原理流程[2] 从图中我们可以很容易观察到这样一个现象： 由于未甲基化的 C 会转变为 T，这种转变会让基因组内的 C 相对变少，ATG 相对变多了； 而对于正常基因组的测序而言： 正常构建的文库，应该是碱基平衡的文库，也就是说，A/C/G/T 四种碱基的比例，各占 25% 左右； 只有这样，测序仪对碱基的判读才会更准确。如果缺少了一种或者几种碱基，测序仪对碱基的判读就会出现问题。测序得到的数据质量就会下降。 而甲基化文库中经过亚硫酸氢盐处理，绝大多数的 C 都变成了 T。所以，这个文库中是严重地缺少 C 碱基的，也就是四种碱基的比例是严重不平衡的。 这时候再来测序，得到的数据质理就较差。 这就是 BS-Seq ………………………………