《PNAS》：信息论角度以局部信息解读TCR

文章预览

前天，伦敦大学学院 Andreas Tiffeau-Mayer 通讯在《 Proceedings of the National Academy of Sciences 》发表论文“ Limits on inferring T cell specificity from partial information ”，引入了一种信息论方法来解决从部分信息解读 T 细胞受体（ TCR ）特异性这一挑战，为 TCR 序列特征及其与抗原特异性的关系提供了有价值的见解。 研究首先提出了一个基于重合的统计框架。该框架用于测量 TCR 库中的抗原驱动选择。特征被定义为将 TCR 序列映射到类别的随机变量。通过计算重合熵和互信息来量化这些特征的信息含量。与背景 TCR 相比，在针对同一表位的 TCR 中多样性降低最多的特征是最具信息量的特征。这种方法还能够识别不同 TCR 区段之间的协同作用和冗余。 作者探讨了信息度量与分类错误之间的联系。他们考虑了一种分类设置，即任务是在一个初始库中识别针对某一表位的 TCR ………………………………