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今天介绍的是一个细胞通讯工具 DcjComm,功能全而强大。 现在都在走这条路线了,配体➡️受体➡️转录因子( 前几天那篇 Cellchat原作者发的 Nature Methods 还做了转录因子模块 )➡️靶基因➡️通路富集分析(要可解释,看看到底那些基因受影响了),这一套下来,故事也圆了。 下面👇其实就是Cellchat的升级版了,没想到才过几天就又有一篇相似的文章了。 这篇Nature Methods绝了,后面大家做单细胞或空间的细胞通讯肯定离不开这个 今天这篇文章是 哈尔滨医科大学的 蒋庆华等老师开发的,我上个月刚介绍完他们的一篇 NC的工作,也是关于细胞通讯的,讲单细胞与空间数据结合来做单细胞哦分辨率的空间细胞通讯,很不错。 DeepTalk模型,NC刚发表的的细胞通讯方法,功能很强大 今天这个代码安装 # 安装和加载 DcjComm 包和其他依赖包 library(devtools) devto
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