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深度学习已经广泛应用于蛋白质改造优化,但基于催化原理的功能蛋白质的从头设计还没有突破。近期中国科学院天津工业生物技术研究所的江会锋团队在 Research 杂志上发表题为“Cytochrome P450 Enzyme Design by Constraining Catalytic Pocket in Diffusion Model”文章,通过揭示自然界细胞色素P450酶新功能进化原理,首次创建了一种基于扩散模型的新酶设计方法,能够精准的设计出具有指定功能的P450酶序列,成功率约60%。 Citation: Wang Q, Liu X, Zhang H,Chu H, Shi C, Zhang L, Bai J, Liu P,Li J, Zhu X, et al. Cytochrome P450Enzyme Design by Constrainingthe Catalytic Pocket in a DiffusionModel. Research 2024;7:Article0413. https://doi.org/10.34133/research.0413 研究背景 细胞色素P450酶在几乎所有生物体中普遍存在,由于其在选择性氧化惰性碳氢键方面的卓越能力,被誉为“万能催化剂”。尽管诺贝尔奖得主弗朗西丝·阿诺
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