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mstate包,借助ggplot2包绘制竞争风险曲线

R语言统计与绘图  · 公众号  ·  · 2024-07-15 21:17
    

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今天来学习使用mstate包绘制竞争风险曲线。 这个包可以借助ggplot2绘制图形。 1. 加载R包 library (mstate) library (dplyr) 2. 加载数据 本案例数据来自R自带数据集(survival包的mgus2),共计1341名单克隆丙种球蛋白病患者,结局事件定义为"发生浆细胞恶性肿瘤",而某些患者在"发生浆细胞恶性肿瘤"之前因为其他原因死亡,那这些发生其他死亡的患者就无法观察到"发生浆细胞恶性肿瘤"的终点,也就是说"其他死亡"与"发生浆细胞恶性肿瘤"存在竞争风险,故采用竞争风险模型分析。 加载数据,并定义结局为因子变量。 dt dt$etime 0, dt$futime, dt$ptime) dt$event 0,  2 *dt$death,  1 ) dt$event 0: 2 ) glimpse(dt) # 数据说明 age     # 年龄 sex     # 性别 dxyr    # 疾病诊断的年份 hgb     # 血红蛋白;\ creat   # 肌酐;\ mspike  # 单克隆血清样的大小 ptime   # 直至发展为浆细胞 ………………………………

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