《PNAS》：新冠移码子假结的构象改变

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移码是包括冠状病毒在内的许多病毒从紧凑的 RNA 基因组产生病毒蛋白的关键机制。移码元件（ FSE ）中的特定 RNA 折叠促进了这一过程， FSE 已成为重要的治疗靶点。对于 SARS-CoV-2 而言，一种特定的三茎 RNA 假结已被证实可刺激移码。然而，先前的研究以及作者基于 RNA- 图（ RNA-As-Graphs ）的分析和化学反应性实验表明，还存在其他折叠形式，包括一种不同的假结。尽管结构可塑性被认为在移码过程中起关键作用，但不同 FSE RNA 折叠之间的转变途径此前尚未明确。 前天，纽约大学 Tamar Schlick 通讯在《 Proceedings of the National Academy of Sciences 》发表论文“ Heterogeneous and multiple conformational transition pathways between pseudoknots of the SARS-CoV-2 frameshift element ”，运用过渡路径采样（ TPS ）、马尔可夫状态建模（ MSM ）以及 BOLAS 自由能方法，对两个关键 FSE 假结之间的原子 ………………………………