专栏名称: 青椒医学
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准备好迎接3D空间转录组了吗?过来了解!

青椒医学  · 公众号  ·  · 2024-08-03 08:15
    

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咨询国自然知识,联系Lion老师: 微信扫一扫添加 准备好迎接3D空间转录组了吗? Open-ST: https://rajewsky-lab.github.io/openst/latest/ 参考文章Open-ST: High-resolution spatial transcriptomics in 3D(Cell) 空间转录组学(ST)方法的开发和应用得到了极大的发展与标准的单细胞方法不同,ST保留了捕获的转录组的空间背景,因此可以直接观察细胞的排列及其在组织空间中的相互作用。这些数据是理解健康分子机制的基础,对于确定和靶向疾病的分子起源至关重要。 技术包括Visium (Genomics), CurioSeeker (Curio Bioscience)和Stereoseq (STOmics)基于探针的方法,包括CosMx空间分子成像仪(Nanostring),分子制图(Resolve Biosciences)和Xenium In Situ (Genomics),针对预先设计的基因组,因此不适合无偏发现或空间基因分型。 最后,虽然细胞以3D方式运作和交流,构建功能性组织和器官,但目前还没有端到端的 ………………………………

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