国自然申请|研究“蛋白与RNA互作”的几种经典技术以及注意事项

主要观点总结

本文介绍了蛋白与RNA互作的技术及相关注意事项，重点介绍了RNA pulldown、RIP-Seq、CLIP-Seq、RNA EMSA实验以及RNA与蛋白共定位的技术。文中还提到了在线工具在预测RNA-蛋白互作的局限性，以及进行这些研究时需要注意的细节问题。

关键观点总结

关键观点1: 介绍蛋白与RNA互作的技术

文中介绍了RNA pulldown、RIP-Seq、CLIP-Seq和RNA EMSA实验等技术，这些技术主要用于研究蛋白与RNA的互作。

关键观点2: 说明蛋白与RNA互作的注意事项

文中强调了在使用在线工具预测RNA-蛋白互作时需要考虑的组织或细胞特异性问题，以及进行细胞体系实验时需要注意的细节，如间接介导因子的存在、分组设置的重要性等。

关键观点3: 介绍RNA与蛋白共定位的技术

文中介绍了RNA与蛋白共定位的研究流程，包括样本准备、标记技术、成像和图像分析等环节。

文章预览

在前面 2 期内容中，我们分别梳理了蛋白 - 蛋白互作( 国自然申请|“蛋白-蛋白互作”的10种常用技术，让专家“眼前一亮”的技术来了！ )以及小分子药物与蛋白互作的技术( 国自然申请|“小分子药物-蛋白互作”的7种常用技术，让专家“眼前一亮”的技术来了！ )，今天我们来介绍总结 蛋白与 RNA 互作的技术以及相关注意事项 ，技术上我们重点介绍这几种经典的实验： RNA pulldown 、 RIP-Seq 、 CLIP-Seq 和 RNA EMSA 实验、 RNA 与蛋白共定位 。 说明： 1.   RNA 与蛋白互作可以从 RNA 和蛋白这两个角度展开。从 RNA 的角度来说： RNA 与蛋白的互作可用于解释 RNA 的稳定性变化、 RNA 翻译、 RNA 定位等过程，因此在进一步研究 RNA 与蛋白互作之前， 一般都要先确认 RNA 本身发生的这些改变，特别是有不少项目关注的是 RNA 修饰（比如 RNA m7G 等） ，然后再通过与之结合 ………………………………