专栏名称: 生信钱同学
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实用型绘图技巧分享——如何让热图的列聚类按照自己的想的顺序展示呢

生信钱同学  · 公众号  ·  · 2024-12-12 09:43
    

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不设置🌟有时会收不到公众号内容, code一段时间后会失效 ,代码在 文末 很多小伙伴反应不会绘图,其实我之前分享的那些源代码绘图都挺好的,但确实需要一些门槛,猛的一看会有一些看不懂,后面准备开一个绘图的专题,把一些有用的,好看的绘图代码分享出来,包含示例数据,让大家从读取到出图一步到位。(如下) 在做单细胞测序的Ro/e分析(主要还是看细胞类型丰度差异的,昨天介绍了另外一种方法 又看到这个单细胞差异丰度分析用在顶刊上了,可以试下 ),虽然纵坐标的聚类结果符合我的预期,但还是有一些不完美,我想要让他们按照我的等级顺序进行展示,如下图(右边的👉) 怎么实现呢,👀下面的代码 library(pheatmap) library(ggplot2) roe "./roe.rds" ) # 1. 计算行间距(欧氏距离) row_distance = dist(roe, method = "euclidean" ) # 2. 进行行聚类 row_ ………………………………

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