专栏名称: 生信宝典
生物信息分析入门、晋级和经验分享。Linux、R、Python学习教程;高通量测序数据分析学习教程;生信软件安装教程。所有内容均为原创分享,致力于从基础学习到提高整个过程。
今天看啥  ›  专栏  ›  生信宝典

5 篇 NAR | 生物大数据时代,如何做好数据管理和再利用,发IF10+的数据库文章?

生信宝典  · 公众号  · 生物  · 2024-08-11 21:00

主要观点总结

文章介绍了多个生物信息学数据库,包括中医药方剂数据库、Prophage hunter、海洋天然产物数据库等,并详细描述了它们的特点和功能。此外,文章还提到了高通量数据分析必备工具,如基因组浏览器,并展示了其使用介绍和在线功能。文章最后提到更多数据库还在建设中,并鼓励读者提出展示和需求建议。

关键观点总结

关键观点1: 生物信息学数据库的概述

文章系统梳理了常用功能数据库,并分享了9个承建发表的数据库。

关键观点2: 中医药方剂数据库的特点

该数据库收录方剂、药材、靶点、疾病、通路等信息,网站设计精美,交互性强。

关键观点3: 其他数据库的介绍

文章还介绍了Prophage hunter、海洋天然产物数据库等,并描述了它们的功能和特点。

关键观点4: 高通量数据分析工具的重要性

文章强调了高通量数据分析工具如基因组浏览器的重要性,并提供了使用介绍和在线功能展示。

关键观点5: 数据库建设的未来

文章提到更多数据库还在建设中,鼓励读者提出展示和需求建议,展示更多的交互式图和功能。


文章预览

生物信息分析离不开数据资源和数据库, 生物信息学数据库分类概览 (第一版) 系统梳理了常用功能数据库。 下面再分享9个我们承建发表的数据库,5篇NAR,一篇BIB,一篇Nature protocols,2篇Science Bulletin,一篇iMETA,一篇APSB,一篇 Nature Genetics,总计影响因子180+,以飨读者。 中医药方剂的数据库,收录方剂、药材、靶点、疾病、通路等信息, 网站古色古香,设计精美,交互探索,网络大气, 高颜值是很好的敲门砖, 于2018年发表于 NAR 杂志。 (http://www.tcmip.cn/ETCM/) 表格展示太枯燥,关键信息 交互式饼图 展示,查看,点击筛选~~ 现在数据库升级第二版,更多功能,更多展示 (网络图比下面这个更漂亮,更有生物意义,更有交互性,只是暂时还不能释放 o(╥﹏╥)o),第三版也在进行投稿中。 另一个是`Prophage hunter`,在细菌基因组中寻找活性噬菌体。 ………………………………

原文地址:访问原文地址
快照地址: 访问文章快照
总结与预览地址:访问总结与预览