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aBIOTECH | 王文团队及合作者发现新型TnpB转座子核酸酶工具可以对植物基因组进行有效编辑

生信宝典  · 公众号  · 生物  · 2024-08-09 21:00

主要观点总结

本文介绍了基因编辑技术在植物领域的应用,特别是TnpB转座子核酸酶在水稻基因编辑中的使用。文章详细描述了三种TnpB系统的测试和使用情况,并分析了其在水稻基因编辑中的效果和精准性。

关键观点总结

关键观点1: 基因编辑技术的建立和发展促进了生命科学领域的研究和应用。

CRISPR/Cas9和CRISPR/Cas12是最常用的基因编辑系统,已广泛应用于动物、植物和微生物的基因编辑。

关键观点2: TnpB转座子核酸酶作为微型基因编辑工具具有开发潜力。

TnpB由IS200/IS605等原核转座子家族编码,含有较少的氨基酸,近期被用于动物和微生物的基因编辑。

关键观点3: 首次使用多种TnpB系统成功在水稻中进行基因编辑。

研究团队使用ISAam1、ISYmu1和ISDra2三种转座子核酸酶系统在水稻中进行了测试,其中ISDra2和ISYmu1系统成功编辑了OsPDS基因并产生了白化苗水稻。

关键观点4: TnpB系统在植物基因编辑中的精准性得到评估。

通过全基因组测序,未在预测的潜在脱靶位点附近检测到突变,表明TnpB系统具有较高的精准性。

关键观点5: 三种TnpB系统在水稻中的基因编辑效果得到进一步评估。

在另外两个水稻内源基因(OsYSA和OsCERK1)上的测试表明,ISDra2和ISYmu1 TnpB系统能够稳定诱导植物基因编辑并扩展了靶基因编辑位点。


文章预览

基因编辑技术的建立和发展极大促进了生命科学领域的研究以及应用,CRISPR/Cas9、CRISPR/Cas12作为最常用的两种基因编辑系统已经被广泛应用于动物、植物以及微生物基因编辑。Cas9含有1000-1500个氨基酸,Cas12a含有1100-1300个氨基酸,都相对较大,对于递送过程有较大限制。TnpB是由IS200/IS605等原核转座子家族编码,在进化上可能是Cas12的祖先,仅含有400-500个氨基酸,作为 微型基因编辑工具 有较大开发应用潜力, 最近中科院动物所王皓毅和张勇研究员团队发现多 种TnpB系统可以用于动物以及微生物的基因编辑,但是否能用于植物基因编辑尚不清楚。 近日,西北工业大学 王文 教授与 王皓毅 和 张勇 研究员团队以及三杰牧草(杨凌)研究院有限公司联合在 aBIOTECH   发表了题为 “ Genome editing in plants using the TnpB transposase system ” 的研究论文 ,首次使用多种Tn ………………………………

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