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生信益站,一点就有益 ! 祝友友们天天开心,月月发 CNS~ 设我为🌟星标,每天就能第一时间看到推送啦~ exFINDER:利用单细胞转录组数据识别外部通信信号 exFINDER 是一种利用信号通路的先验知识在单细胞转录组学数据集中 识别外部信号 ( 从外部系统接收的信号 )的方法。具体来说,exFINDER 包含以下特点: 它开发了一种计算方法,将先前的知识和 scRNA-seq 数据联系起来, 以识别细胞接收的外部信号 。 它使用一种计算模型,利用图论来 推断外部信号-目标信号网络(exSigNet)并将表达数据与信号强度联系起来 。 它为 外部信号-目标信号网络(exSigNet)的 可视化和分析 提供了多种方法 。 exFINDER 概述 A、exFINDER 需要 scRNA-seq 数据、用户指定的细胞簇标签和用户选择的靶基因作为输入。 B、对于特定的生物学问题,可以包括其他信息,例如差异表达基
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