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生信狂人团队
不想做传统孟德尔随机化,想发高分SCI,可以考虑这种超级大数据挖掘
生信狂人团队
·
公众号
· · 2024-09-03 11:02
文章预览
MR可以做临床方向,也可以做基础方向,如果你不单单为了发文章,还要考虑如何与自己申请课题、研究生开题结合起来的话,就是可以利用各类QTL数据进行挖掘,可以做纯的数据挖掘,也可以补上基础实验,可以根据自己的实际情况出发。 具体思路可以参考这篇文章: 作者做的是可用药基因, 基因是可以替换的,你可以做所有基因筛选,也可以做自己认为有意义的特定基因,例如自己测序或是、基础实验、生信分析筛出的基因。 这篇范文的思路是eQTL筛选、共定位进一步筛选、pQTL验证, 如果我们觉得深度不够或者工作量不够,我们还添加SMR分析、mQTL分析,SMR之前是分享过了,现在重点是来讲解一下mQTL的思路。 1、可用药基因的搜索 2、可用药基因的eqtl、pqtl数据下载 3、利用MR批量(eqtl)筛选阳性结果的可用药基因 4、利用共定位进一步批量筛 ………………………………
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