Nat Struct Mol Biol丨任兵/胡明/于淼团队揭示小鼠胎儿发育过程中转录调控相关染色质三维结构的动态变化

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多细胞生物发育过程中，基因表达具有谱系特异性与发育阶段特异性，这一过程受到谱系特异性转录因子与增强子等功能性顺式转录调控元件 （cis-regulatory elements, CRE） 的严格调控。2020年，DNA元件百科全书 （ENCODE） 计划第三阶段系统绘制了小鼠胎儿发育的多组织多发育阶段的转录与表观遗传图谱，注释了数十万个发育相关的CRE元件。然而，由于CRE常跳过距其线性距离最近的基因转而调控更远的基因，因此这些CRE元件调控的靶基因尚不明确。 CRE，尤其是增强子对其靶基因的远程调控依赖于在线性基因组中距离较远的两个染色质位点在空间中形成远程互作。近年来多项研究表明，染色质远程互作是基因组转录调控机制中的重要一环，而利用高通量测序技术检测发生在增强子与启动子间的染色质远程互作是识别增强子靶基因的有效手段。然而，目前尚 ………………………………