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分子对接的底层原理

精准药物  · 公众号  ·  · 2024-06-03 06:30
    

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01 什么是分子对接 分子对接( molecular docking )是一种计算化学方法,用于研究分子(例如药物)和分子(例如靶标蛋白)之间的相互作用。 它在原子水平上模拟了小分子在生物大分子表面上的结合方式,以预测它们之间可能的结合模式和结合能力,从而来以评估药物的活性和选择性或了解药物与蛋白之间相互作用背后的基本生化过程。 该技术的基础是已经解析确定的蛋白质结构,包括但不限于 X 射线晶体学、核磁共振波谱或冷冻电子显微镜等技术获得的高分辨率靶蛋白 3D 结构。分子对接在药物设计和发现、酶机理研究以及生物分子相互作用的理解方面具有广泛的应用前景。 图1,分子对接示意图 02 分子对接的底层原理 就像我们眼睛所能看到的各个物体均遵守包括牛顿定律、法拉第定律及热力学定律等物理化学定律一样,微观尺度的原子或分子 ………………………………

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