专栏名称: 生信菜鸟团
生信菜鸟团荣誉归来,让所有想分析生物信息学数据的小伙伴找到归属,你值得拥有!
今天看啥  ›  专栏  ›  生信菜鸟团

【flowjo】流式笔记:流式也能画t-SNE图?

生信菜鸟团  · 公众号  · 生物  · 2024-12-04 12:30
    

文章预览

哦莫哦莫!!!这竟然是用flowjo画出来的,岂不是能够和单细胞图谱很好地结合互为验证~ tSNE - FlowJo Documentation: https://docs.flowjo.com/flowjo/advanced-features/dimensionality-reduction/tsne/) FlowJo多通道tSNE降维流式分析图 - https://www.bilibili.com/opus/732115658681090169) 以小鼠骨髓为例,就能得到: 图中只显示了部分细胞亚群哦~ 然后,昨晚在群里有小伙伴发现了单细胞数据密度图,⬇ 这不就是流式的密度图?? 问题在于,这是咋做出来的? 所以这个图应该是基于 BBrowser 平台做的, https://bioturing.com/bbrowser/download (这是收费的~) 如果课题组经费充足,而单细胞分析的水平有限,推荐去看看这个平台,用户指南➡[https://talk2data.bioturing.com/document#h.i4qjc3yovdg7) 参考文献 [1] Yang B, Davis JM, Gomez TH, et al. Characteristic pancreatic and splenic immune cell infiltration patterns in mouse acute pancreatitis. C ………………………………

原文地址:访问原文地址
快照地址: 访问文章快照
总结与预览地址:访问总结与预览