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survtype-分子分型的利器-能让生存同时有意义的分子分型R包

灵活胖子的科研进步之路  · 公众号  ·  · 2024-08-02 00:22

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简介 教程地址:https://rdrr.io/bioc/survtype/f/vignettes/survtype.Rmd 特点 1.无监督聚类的算法应用的是层次聚类。 2.函数会根据患者的生存风险首先将患者划分分组 3.根据分组信息,函数可以应用clustersel包应用穷举法选择最能够区分两个分组信息的基因。 4.函数可以自动返回热图,可以方便的绘制生存曲线。 5.SE对象只需要提取表达谱数据就可以正常运行。 1.仅包括临床数据 # 1. 单纯临床资料用法---------------------------------------------------------------------- #根据生存资料构建分组 data( "cancer" ) ovarian.survtype                                   time =  "futime" ,                                    status =  "fustat" ) ovarian.survtype $cluster #绘制生存曲线 plot.survtype(ovarian.survtype,                pval = TRUE) 测试数据 函数可以返回所有患 ………………………………

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