MiLoPYP:自监督分子模式挖掘与原位粒子定位

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加 星标 ，再也不怕错过更新！方法见文末动图。 冷冻电子断层扫描结合单粒子断层扫描可三维可视化细胞景观，并在自然环境中获得频繁出现的生物大分子的近原子分辨率结构。然而，细胞内分子拥挤、冷冻电子断层扫描特有的成像畸变以及断层数据集的巨大规模，使得冷冻电子断层扫描/单粒子断层扫描在蛋白质的自动识别和定位上面临挑战。 为了突破现有挑战，9月的 nature methods 上介绍了一种基于对比学习的两步数据集特定框架 （MiLoPYP） ，用于快速分子模式挖掘和精确蛋白质定位。MiLoPYP能够有效检测和定位球状、管状复合物及大型膜蛋白，简化并扩展高分辨率原位结构测定工作流程。 01 MiLoPYP的工作流程 MiLoPYP是一个深度学习框架（图1），包含细胞内容探索和蛋白质特异性定位模块。探索模块利用高斯差分 （DoG） 金字塔识别关键坐标，提 ………………………………