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文献分享|Nature Methods|使用SpatialGlue解析空间多组学数据

杨朝勇课题组  · 公众号  ·  · 2024-07-12 09:00

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大家好!为大家介绍一篇 2024 年发表在  Nature Methods 的文章,题目为 “ Deciphering spatial domains from spatial multi-omics with SpatialGlue ” 。 本文中,作者开发了 双重注意力机制图神经网络模型 SpatialGlue ,利用空间多组学数据对组织样本的空间域进行高分辨率的识别和解析。 本文的通讯作者是新加坡科学技术研究局的陈金妙教授,她的研究方向为单细胞数据分析算法开发、系统免疫学和微生物组学等。 背景介绍 空间转录组技术能够在空间分辨率上描绘基因的表达模式,有助于解析组织结构的复杂性。然而,仅有转录组学数据不足以全面揭示细胞和组织的全部特性,因此,对多个组学数据进行整合分析十分重要。多组学数据整合面临的挑战主要在于不同组学之间特征数量有巨大差异,并且分析所用的统计方法不同。为了充分利用多组学数据来构建全面的组 ………………………………

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