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国自然申请|研究“细胞-细胞间交互”的方法总结

猫头鹰教室  · 公众号  ·  · 2025-02-18 11:00
    

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上次 “ 细胞 - 细胞交互 ” 这个主题我们介绍了 " 外泌体"和"隧道纳米管"介导的"线粒体转移 " ,本期汇总研究 “ 细胞 - 细胞交互 ” 的方法,这里我们主要说 基于配体 - 受体结合的细胞间互作研究方法 ,既然这种互作方法的模式是 “ 细胞 1 的配体 L 和细胞 2 的受体 R 的结合 ” ,就既 包括了细胞 1 与细胞 2 的交互,又包括了配体 L 与受体 R 的结合。 1. 基 于单细胞数据、空间转录组等分析 Ref : The diversification of methods for studying cell-cell interactions and communication. 单细胞的数据大家比较熟悉了,像 CellChat 、 CellPhoneDB 等工具都可实现,需要注意的是使用这些数据的时候有很多 “ 坑 ” (注意事项): 很多人喜欢用“细胞-细胞间交互”报国自然,但是太多坑了…… 由于空转分辨率的问题,配体 - 受体的互作可以大致通过空间分布看到配体与受体分 ………………………………

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