专栏名称: 生信技能树
生物信息学学习资料分析,常见数据格式及公共数据库资料分享。常见分析软件及流程,基因检测及癌症相关动态。
今天看啥  ›  专栏  ›  生信技能树

人工智能大模型不会告诉你的热图绘制技巧

生信技能树  · 公众号  ·  · 2024-09-26 20:05

文章预览

习惯了在做生物信息学数据分析或者相关知识点整理之前,都下意识的问一下人工智能大模型,比如关于热图的绘制, 大模型其实是会优先推荐ggplot2,但是对绝大部分小伙伴来说,不如pheatmap那样的入手简单! 所以,是时候介绍一下ggplot2热图扩展包(ggalign),它可以让你抛去很多ggplot细节但是又保留了它的高度定制化的优点,让我们一起来看看作者对它的介绍吧: ggplot2热图扩展包( ggalign ) 可通过CRAN安装 install.packages("ggalign") ,但最新版本更改了大量内容,建议安装GitHub版本。 # install.packages("remotes") remotes::install_github( "Yunuuuu/ggalign" ) library (ggalign) # 构建数据集 set.seed( 123 ) small_mat 81), nrow =  9 ) rownames(small_mat) "row", seq_len(nrow(small_mat))) colnames(small_mat) "column", seq_len(ncol(small_mat))) 简单热图 ggheatmap(small_mat) + scale_fill_viridis_c() 热图布局 基于树 ………………………………

原文地址:访问原文地址
快照地址: 访问文章快照
总结与预览地址:访问总结与预览