《Nature》撤稿一项重磅论文，相关研究和成果转化均受牵连

主要观点总结

本文主要介绍了一篇关于癌症微生物研究的论文在《Nature》杂志发表后的争议及其后续事件。研究使用机器学习算法检测人体特定微生物与癌症的关联，准确率接近100%。但随后有批评者指出论文存在方法学错误，经过严格审查后，《Nature》最终撤稿该论文。尽管撤稿，但相关研究仍对其他研究产生连锁效应。

关键观点总结

关键观点1: 论文内容及其影响

该研究使用机器学习算法检测人体特定微生物与癌症的关联，准确率有时可接近100%，并引发多项后续研究和一家公司将其转化为早期癌症诊断工具。

关键观点2: 论文撤稿的原因和过程

有批评者指出论文存在方法学错误，经专家同行评审后确认存在问题。《Nature》杂志先发表编辑说明，最终撤回了该论文。撤稿通知指出论文存在问题和结论无法支撑。

关键观点3: 撤稿事件的影响和连锁反应

撤稿事件对其他研究产生了连锁效应，包括使用论文数据集的其他研究。一些研究者对撤稿表示担忧，并探讨可能的解决方案。

关键观点4: 论文作者和公司的回应

通讯作者Rob Knight表示撤稿是合理的，但认为论文的主要结论是真实的。Micronoma公司作为研究成果的转化方，表示其产品未受影响，并正在开发实验性肺癌血液检测法。

关键观点5: 研究的重要性和警示意义

尽管存在争议和撤稿，但研究者强调这不应使整个癌症微生物组的研究失效。同时，该研究作为一个警示性故事，提醒人们批判性看待复杂方法的研究，并加深对生物信息学工具和机器学习方法局限性的理解。

文章预览

2020年3月，《Nature》发表了一篇极具影响力的论文。 该研究使用了机器学习算法来检测人体特定微生物与癌症预测和癌症类型的关联 ，准确率有时可接近100%。该研究促使了后续多项研究的开展，一家公司甚至将研究成果转化为早期癌症诊断工具。 2023年， 有批评者指出该论文存在方法学错误 。随后，研究受到了严格审查，《Nature》先是在2024年2月发表了一则编辑说明，最终在 6月26日撤稿该论文 。 撤稿通知 写道：“ 专家对读者提出的问题和作者的回应进行了同行评审，确认文章的一些发现存在问题，相应的结论无法得到支撑 。”所有作者都同意撤稿。 撤稿论文： https://www.nature.com/articles/s41586-020-2095-1 该论文的通讯作者是加州大学圣迭戈分校的微生物学家Rob Knight，同时也是微生物组研究的领军人物。Knight在邮件中表示，撤稿是合理的，“但我们 ………………………………