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预测蛋白信号肽序列的方法总结及比较

生命科学技术摘集  · 公众号  ·  · 2025-04-24 08:25
    

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本篇文章由生物帮 SA 成员投稿,欢迎对某些内容感兴趣的同学在周一的文章下留言,本周可留言的文章为【 上周大家的问题答复(20250407-20250413) 】 信号肽是一段位于蛋白 N 端的短序列,类似“邮政编码”,帮助蛋白找到正确的运输路径。 本文将介绍三款经典的在线信号肽预测工具,以及比较每种方法的优劣势。 🔍  工具一: SignalP 1.  进入网站: https://services.healthtech.dtu.dk/services/SignalP-6.0/ 2.  准备蛋白数据:蛋白需要以 fasta 格式递交, fasta 格式包括第一行的蛋白信息介绍, 开头加上   >  ,第二行开始就是氨基酸序列, 例如: >GLR1_DROME Glutamate receptor 1 OS=Drosophila melanogaster GN=GluRIA PE=1 SV=2 MHSRLKFLAYLHFICASSIFWPEFSSAQQQQQ 3.  在输入框粘贴或者直接导入 fasta 文件,并设置以下参数: ①  Organism (物种选择):本次示例文件时来自黑腹果蝇的谷氨酸受 ………………………………

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