预测蛋白信号肽序列的方法总结及比较

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本篇文章由生物帮 SA 成员投稿，欢迎对某些内容感兴趣的同学在周一的文章下留言，本周可留言的文章为【 上周大家的问题答复（20250407-20250413） 】 信号肽是一段位于蛋白 N 端的短序列，类似“邮政编码”，帮助蛋白找到正确的运输路径。 本文将介绍三款经典的在线信号肽预测工具，以及比较每种方法的优劣势。 🔍  工具一： SignalP 1.  进入网站： https://services.healthtech.dtu.dk/services/SignalP-6.0/ 2.  准备蛋白数据：蛋白需要以 fasta 格式递交， fasta 格式包括第一行的蛋白信息介绍， 开头加上   >  ，第二行开始就是氨基酸序列， 例如： >GLR1_DROME Glutamate receptor 1 OS=Drosophila melanogaster GN=GluRIA PE=1 SV=2 MHSRLKFLAYLHFICASSIFWPEFSSAQQQQQ 3.  在输入框粘贴或者直接导入 fasta 文件，并设置以下参数： ①  Organism （物种选择）：本次示例文件时来自黑腹果蝇的谷氨酸受 ………………………………