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用数据库轻松预测分子之间相互作用,19个常用数据库盘点!

科研根号三  · 公众号  ·  · 2024-07-18 17:19

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分子之间相互作用是细胞内分子间通讯的重要方式之一。它涉及蛋白质与蛋白质、蛋白质与核酸以及核酸与核酸之间的相互作用。这些相互作用可以影响细胞内的信号传递、基因表达调控、代谢调控等生物学过程。 除了实验验证分子之间相互作用,我们还可以用数据库预测分子之间相互作用。 本文整理了蛋白-蛋白、RNA-蛋白、DNA-蛋白、RNA-RNA/DNA、化合物-蛋白5类分子互作常用的19个预测数据库,赶紧收藏好 ! 一、蛋白-蛋白 蛋白与蛋白通过形成复合物(complex)来发挥作用,或者蛋白通过直接结合效应蛋白,影响效应蛋白的功能。 1)STRING 官网 :https://string-db.org/ 老牌的蛋白相互作用数据库,数据有保障。研究蛋白之间互作网络,有助于挖掘核心调控基因。覆盖物种最多,互作信息最大,可输入蛋白质名称或序列,单个或多个蛋白。 输入基因名称后, ………………………………

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