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测序数据差的离谱怎么办?不妨试试这些方法,助你弯道超车!

生信图书馆  · 公众号  ·  · 2024-08-01 19:00

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实验坊间曾流传一句话“实验没头绪,不如测个序”。在实验过程中,各种 bug真的是层出不穷,除了数据假 阳性,还有测序结果自相矛盾,得不到有效结论…… 其实测序数据差不外乎以下几个原因: 1.测序样本有问题,比如样本制备时 RNA 降解程度、rRNA干扰等。 2.差异基因筛选条件设置的太苛刻。 3. 不是测序结果差,只是没有你想要的结果。 4.测序公司存在问题(比较少见,但也不是没有这种可能) 除了第一条这个致命问题我们无法改变,后面3条都是可以解决的,比如修改阈值获得更多的差异基因,通过不同的功能富集方法富集通路,找到你想要的机制。 自从测序变成科研标配后,所有课题组都在抢占测序的潮流,渴求着从中分一杯羹。其实今天馆长想跟大家说的是, 科研的道路并不是只有测序一条路可以走,下面这几种方法照样可以助你 ………………………………

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