专栏名称: 生信钱同学
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两篇顶刊,这图做的也是空间组学界的天花板了,一个比一个好看——能学

生信钱同学  · 公众号  ·  · 2024-10-02 07:15

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不设置🌟有时会收不到公众号内容,code一段时间后会失效,代码在 文末 一起来欣赏顶刊绘图吧 ,两篇文章都有代码可以学习,可能学起来就是有点累。 第一篇是Cell,他们就是做空间技术开发的,这次是针对FFPE样本,基本上把所有的RNA都测到了。 他们开发了 一 种名为Patho-DBiT的新技术,用于在临床存档的石蜡包埋组织(FFPE)中进行空间全转录组测序。 Patho-DBiT通过结合 in situ 多聚腺苷酸化和计算创新 ,能 够高灵敏度地探测各种RNA,包括mRNA、miRNA、tRNA等 , 还可以进行基因表达、剪接异构体和小分子非编码RNA的空间共分析 。 该技术尤其适用于存档时间较长的FFPE样本,解决了这些样本中 RNA降解、片段化等 问题。 文章详细阐述了Patho-DBiT的工作原理及其在多个生物样本中的应用。例如,研究人员在一个已存档五年的淋巴瘤FFPE样本中使用了该技术, ………………………………

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