2024了，为什么还有人【重新开发】富集R包？

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点击👇下方，关注益站 。 生信益站，一点就有益 ！ 设我为🌟星标，每天就能第一时间看到推送啦~ 传统的基因集富集分析 通常 仅限于少数本体，并且不考虑基因集或术语的相互依赖性，从而导致p值过度校正 。为了应对这些挑战，科学家引入了mulea ，这是一个提供全面的过度表示和功能富集分析的 R 包。 mulea采用渐进式经验错误发现率 (eFDR) 方法 专门为互联的生物数据而设计 ，可准确识别不同本体中的显著术语。mulea超越了传统工具，整合了 广泛的本体，涵盖基因本体、通路、调控元件、基因组位置和蛋白质结构域 。 这种灵活性使研究人员能够根据他们的具体问题定制富集分析 例如在基因表达数据中识别 富集的转录调节因子 或蛋白质集中 过度表示的蛋白质结构域 。为了促进无缝分析， mulea为 27 种生物提供了基因集（标准化 GMT 格式）， ………………………………