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PeerJ | HtrA3:一种有前途的头颈部鳞状细胞癌预后生物标志物和治疗靶点

生信分析手册  · 公众号  ·  · 2025-03-14 18:00
    

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇文章“ HtrA3: a promising prognostic biomarker and therapeutic target for head and neck squamous cell carcinoma ”,这篇文章发表在 PeerJ 期刊上,影响因子为2.3。 结果: HtrAs在HNSCC中的表达水平显著上调 与邻近的正常组织相比,在来自TCGA数据库的分组样品(图2A)和配对样品(图2B)中,HNSCC组织中的HtrAl-4 mRNA表达水平显著更高。来自GEO数据库的GSE 30784和GSE 31056数据集用于进一步验证。如图2C所示,HtrA 1 -4的mRNA表达水平在HNSCC组织中也显著上调(P < 0.05)。使用cBioPortal在线工具分析HNSCC患者中HtrA 1 -4的每种基因改变。结果显示,在三种HNSCC亚型中检测到扩增、突变和深度缺失(图2D)。突变率在HtrA 4中为7%,在HtrA 2和HtrA 3中均为1.1%,而在HtrAl中仅为0.8%(图2 E)。这些结果表明,HtrAs是相对保守的。 HtrAs在HNSCC中的预后价值 生存分析结果显示HtrA ………………………………

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