Nucleic Acids Research | 华中农大发布首个多作物参考面板数据库

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近日，华中农业大学信息学院生物信息团队在国际著名学术期刊“Nucleic Acids Research”中发表题为“Plant-ImputeDB: an integrated multiple plant reference panel database for genotype imputation”的研究成果。该研究通过收集包括水稻，玉米、小麦、油菜和棉花等12个重要农作物的遗传变异信息，构建了植物中首个多物种的高质量的遗传参考变异库，为植物遗传育种研究提供了宝贵的资源。 基因型填充（Genotype imputation）是根据参考面板（reference panles，又译参考集）中的单体型和基因型对目标样本中缺失基因型的估计填充过程。基因型填充可以有效增加单核苷酸多态性(SNPs)的密度，因此被广泛用于相对便宜和低密度的SNP芯片的填充以进行大规模全基因组关联研究(GWAS)。然而，大多数植物缺乏 ………………………………