NAR | 高珊团队全面优化四膜虫大核基因组注释

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一个完整且注释精准的基因组是解析生物学功能和调控机制的核心基石。基因注释包括编码蛋白基因的编码区 （CDS） 、非编码区 （UTR） 、转录起始位点 （TSS） 和转录终止位点 （TES） 、非编码RNA，以及基因的可变剪切亚型等关键特征的识别的标注。只有通过高质量的基因注释，才能将基因组序列转化为具有生物学意义的信息。 嗜热四膜虫 （ Tetrahymena thermophila ） 是一种广泛应用于基础生物学研究的单细胞模式真核生物，曾因核酶和端粒酶的研究分别斩获1989年诺贝尔化学奖和2009年诺贝尔生理或医学奖。四膜虫大核基因组已历经多次组装和注释，其中包括2020年由中国海洋大学 高珊 教授课题组率先完成的端粒到端粒的完整基因组组装 【1】 。然而，现有的基因注释仍存在诸多不足，例如基因错误注释、TSS和TES位置不准确，以及UTR信息缺失等。近 ………………………………