4+单细胞+WGCNA+机器学习+实验，干湿结合就是如此简单！！

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“ Deciphering smooth muscle cell heterogeneity in atherosclerotic plaques and constructing model: a multi-omics approach with focus on KLF15/IGFBP4 axis”，这篇文章发表在 BMC Genomics 期刊上，影响因子为4.4。 结果： 单细胞数据的质量控制、降维、聚类和细胞类型鉴定 数字1概述了本研究的工作流程（图 1）。对于单单元格数据集GSE159677，第一步涉及质量控制措施。作者排除了特定的细胞并管理了线粒体基因的比例，以确保本研究中使用的细胞样本的质量（图1）。经过质量控制，总共保留了 40,953 个细胞。通过细胞聚类和注释，作者鉴定了十个不同的细胞亚群，包括T细胞、平滑肌细胞、内皮细胞、巨噬细胞、单核细胞、成纤维细胞、B细胞、浆细胞、浆细胞样树突状细胞和肥大细胞（图1）。数字2D表示与每种细胞类型相关的重要标记基因（图1 ………………………………