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Nature Genetics |基因组所周永锋团队建立葡萄全基因组选择育种体系

Biomamba 生信基地  · 公众号  ·  · 2024-11-05 09:05

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写在前面 葡萄是一种具有重要经济价值的多年生水果作物,可作为水果食用或作为酿造葡萄酒的原材料,已有逾万年的驯化历史 [1] ,并且在驯化过程中积累了大量的有害突变 [1-3] 。 由于育种周期长,育种性状的遗传学研究不深入,遗传转化体系不成熟,尚未广泛应用多组学与人工智能等革命性技术,葡萄的生物育种体系明显滞后于一年生粮食作物 。以往的研究由于技术限制,结构变异尚未得到充分研究,而他们对性状的影响至关重要 [4-7] 。此外,以往的单参考基因组分析方法也会引入参考基因组偏差。随着三代基因组测序技术的出现,完整基因组以及泛参考基因组的构建已经使得进一步解析葡萄重要农艺性状成为可能 [8, 9] 。在当前的育种 4.0 时代,引入机器学习的全基因组选择算法提高基因组预测准确率,使得实现快速、高效、低成本的葡 ………………………………

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