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单细胞泛癌分析轻松发10分思路推荐

生信人  · 公众号  · 生物  · 2024-11-19 07:04

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代谢重编程是癌症的一个关键特征,癌细胞通过重新编程代谢通路来满足快速增殖所需要的能量和物质,因此目前代谢重编程是肿瘤研究的热点。小编和大家分享一篇 今年10月 刚刚发表在 eBioMedicine(IF 9.7/Q1) 杂志上题为: Single cell atlas reveals multilayered metabolic heterogeneity across tumour types 的文章,该研究全面分析了六种癌症的单细胞数据,刻画了恶性细胞代谢重编程的模式及其与微环境和临床结局的关联。研究逻辑清晰,思路流畅,十分具有参考价值。 添加微信 精彩推送不错过 一.文章摘要 研究收集了来自乳腺、结肠、肺、胃、胰腺以及前列腺6种癌症的296个肿瘤及对照样本的单细胞测序(scRNA-seq)数据,构建了代谢基因表达的单细胞图谱,并识别了细胞类型特异性代谢重编程模式 (图1a) 。 具体来说研究基于肿瘤样本的单细胞数据利用非负矩 ………………………………

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