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Single Cell Portal数据库查找与下载数据

生信漫漫学  · 公众号  ·  · 2024-09-17 09:30

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写在开头 好早好早之前就简单整理分享了一下单细胞的常用数据库—— 单细胞数据获取及格式介绍 而且还信誓旦旦的开了个新专辑,想着整理一下常见数据库的使用。不过 结果就是整理了两个就搁置了,所以Flag就不立了,用到啥数据库就整理啥吧! 这次一起来看看 Single Cell Portal数据库的使用 ,主要是 从数据库查找与下载数据。 Single Cell Portal数据库简介 Single Cell Portal是一个单细胞研究项目数据库,可以用于 查询研究项目和基因在不同细胞类型中的表达情况 ,目前包含 740个研究项目 和超过5027万个细胞的数据信息 可以根据研究项目或者基因进行搜索 收录的数据集会整理: summary 模块:对数据集进行简介 Explore 模块:可以查看数据集可视化的情况 Download 模块:下载数据存放处,需要登陆后才可以查看 数据查找 每个收录在Single Cell Portal的数据 ………………………………

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