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肿瘤免疫微环境关联非编码RNA,10种算法构建模型预测肺腺癌患者预后

生信学霸  · 公众号  ·  · 2024-12-02 11:05
    

主要观点总结

本文报道了一项研究,该研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,开发了一个与肺腺癌(LUAD)肿瘤免疫微环境相关的lncRNAs预后模型TRLS。该模型能够预测肺腺癌患者的总体生存,并有助于指导个性化治疗和预后管理。

关键观点总结

关键观点1: 研究背景

肺腺癌是世界第二大常见癌症,尽管有分子靶向治疗和免疫检查点阻断治疗等新的治疗手段,但肺腺癌患者的5年生存率仍不容乐观。

关键观点2: 研究目的

开发一个基于肿瘤免疫微环境相关lncRNAs的预后模型TRLS,以有效预测肺腺癌患者预后并指导个性化治疗。

关键观点3: 研究方法

使用WGCNA分析、单细胞转录组分析、机器学习算法、免疫浸润分析等技术手段,从GEO和TCGA数据库获取数据进行分析。

关键观点4: 研究结果

成功开发了一个基于TIME相关lncRNA的预后模型TRLS,并通过内部和外部验证评估了其预测价值。此外,还探究了TRLS与基因组变异和免疫治疗反应的关系。

关键观点5: 研究意义

TRLS模型对于预测肺腺癌患者的预后和免疫细胞浸润水平具有潜在价值,并可能有助于指导个性化治疗和免疫治疗反应评估。


文章预览

Single-cell RNA sequencing integrated with bulk RNA sequencing analysis identifies a tumor immune microenvironment-related lncRNA signature in lung adenocarcinoma 肺癌是世界第二大常见癌症,其主要病理亚型为肺腺癌(LUAD)。虽然分子靶向治疗和免疫检查点阻断治疗的出现和发展为LUAD患者提供了更多的治疗选择和临床益处,但LUAD患者的5年生存率仍不容乐观。目前,亟需开发针对预后不良的LUAD患者的鉴别和检查方案,以提供个性化治疗。 BMC Biology  上发表的新文章 成功开发了一个基于肿瘤免疫微环境相关lncRNAs的预后模型TRLS,该模型可有效预测肺腺癌患者预后并指导个性化治疗。 期刊:BMC Biology(IF 4.4) 出版商:BioMed Central 发表:2024年3月22日 DOI: https://doi.org/10.1186/s12915-024-01866-5 关键词:肺腺癌 | 肿瘤免疫微环境 | 单细胞转录组 | 免疫疗法 技术手段:WGCNA分析、单细胞转录组分析 ………………………………

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