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Genome VarScan | 基于Assembly的基因结构变异检测效果显著提升!

生信石头  · 公众号  ·  · 2025-01-18 15:20
    

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正值双节,休假一周。休假前夕,我收到了一封邮件。不能说不难受,只能说非常难搞。 「Genome VarScan」插件 ,一开始是想着后续要做一些杂交育种,开发一些分子标记,方便做真假杂种鉴定等等。当然,也可以用来快速开发标记区分手上种质。无奈之下,杂交育种工作基本是无望了,原因众多。当然,我说是材料问题也不为过。不过我后续发现,似乎不少做育种的朋友还挺喜欢这个插件。起码是用起来,用来开发分子标记,用于发表论文的分析工作,用于申请专利等等。具体一时间找不到推送,就不展开。 回到主题,收到了刘博士的邮件,如下 大体体积,TBtools 的 「Genome VarScan」表现不太行。这个有点复杂,因为「Genome VarScan」这个插件其实我觉得效果还可以,参考以前的推文,也有老师专门与我说很好用云云。但参考邮件描述,确实不太行。 ………………………………

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