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大家好!为大家介绍一篇 2024 年 8 月发表在 Nature Communications 的文章,题目为 “Tissue characterization at an
enhanced resolution across spatial omics platforms with deep generative model” 。本文中,作者发展了一种名为“ soScope ”的统一生成式模型,旨在提升从多种空间技术获取的分子图谱的数据质量和空间分辨率。 这个模型能够融合组学数据、空间关系以及图像等多模态组织信息,推导出具有增强分辨率的组学图谱 。本文的通讯作者是清华大学成像与智能技术实验室 戴琼海院士团队 与北京航空航天大学人工智能学院 邓岳教授 01 背景介绍 近年来,空间组学技术取得了显著发展,使得从转录本(如 Visium 和 seqFISH )、蛋白质(如 spatial-CITE-seq )、表观遗传标记(如 spatial ATAC-seq 和 spatial-CUT )到基因组变异(如 slide-DNA-seq 和 DNA-seqFISH )等多种分子的空间分析成为
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