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scCustomize一键美化小提琴图

单细胞天地  · 公众号  ·  · 2024-12-11 16:35
    

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写在开头 前两期整理的关于 scCustomize介绍 以及 美化FeaturePlot的结果 ,然后发现除了FeaturePlot还可以美化小提琴图、气泡图以及UMAP等可视化的图 之前基于VlnPlot以及ggplot2也整理过小提琴图及其美化,以及一些小知识点的推文 那这期一起来看一下,使用scCustomize更加简单快速的美化小提琴图。 Stacked_VlnPlot可视化 当我还在研究比较Stacked_VlnPlot以及VlnPlot常用参数设置的时候,还在疑惑Stacked_VlnPlot为什么没有将 stack = TRUE 设置为默认选项,然后发现这个函数的名字就是堆叠小提琴图 当然 在VlnPlot中也可以通过参数调节去通过堆叠小提琴图展示关注的基因—— 基于VlnPlot参数及ggplot2美化小提琴图 但往往 需要同时设置stack:是否水平堆叠每个特征的图表以及flip:翻转图表方向(身份类别在x轴上)两个参数,比较麻烦 。那 Stacked_VlnPlot 函数就很好的解决了这 ………………………………

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