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前面 单细胞免疫组库VDJ|和Nature学STARTRAC，定量T细胞动态变化 介绍了 2018年NATRUE 文章中的 STARTRAC 方法，可以应用于单细胞免疫组库数据来 揭示T细胞动态变化 的分析。可以定量刻画T细胞的组织分布、克隆扩增情况、组织迁移和状态变化等。 scRNA分析|使用AddModuleScore 和 AUcell进行基因集打分，可视化 ， scRNA|使用scMetabolism完成单细胞代谢激活分数估计 也介绍了使用AUCell 和 特定基因集对单细胞转录组数据进行评分。 那两者结合在一起呢？ 就是SCI很常见的分析内容， 结合Startrac得到的T细胞相关指数（克隆，迁移，状态变化等）与 “目标指数” 之间的相关分析内容。 一 载入R包， 数据 library ( tidyverse ) library ( Seurat ) library ( ggsci ) library ( Startrac ) library ( tictoc ) library ( data .table ) library ( ggrepel ) library ( GSVA ) library ( openxlsx ) 使用 单细胞免疫组库VDJ|和Nature
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