专栏名称: 生信分析手册
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4+PPI+表达验证+ceRNA网络,还是这篇文章性价比高!

生信分析手册  · 公众号  ·  · 2024-11-20 18:00

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“Identification of potential therapeutic target SPP1 and related RNA regulatory pathway in keloid based on bioinformatics analysis”,这篇文章发表在 Ann Med 期刊上,影响因子为4.9。 结果: DEGs 的筛选 为了对微阵列数据进行统计评估,用 R 编程语言分析了基因表达的变化。在 R 中测量的稳健多数组平均表达用于所获数据的归一化。标准化后,样品的平均基因表达值基本相同 。从箱形图中,作者可以观察到在去除批次效应之前数据集之间样本分布的显著差异,这表明存在批次效应。删除批处理效应后,数据集之间的数据分布趋于一致,中值位于一条线上。总体而言,在  GSE351  数据集中筛选了 260 例 DEGs,其中 91 例下调,7890 例上调;在  GSE459  数据集中筛选了 145725 个 DEGs,包括 247 个下调基因和 212 个上调基因;在数据集 GSE662 中鉴定出 121 ………………………………

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