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单细胞居然已经卷到双疾病分析了!

生信人  · 公众号  · 生物  · 2024-05-21 07:00
    

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急性胰腺炎是全球常见的危重急性胃肠道疾病,然而,其外周血中的基因表达模式尚未得到充分分析,大量报道表明COVID-19感染可能导致急性胰腺炎,但是, COVID-19引起急性胰腺炎的机制尚未得到研究 。 双疾病单细胞思路 扫码咨询 该研究对来自100多个人类血液样本的测序数据进行WGCNA分析,这些样本分为健康组,轻度急性胰腺炎(MAP),中重度急性胰腺炎(MSAP)和重症急性胰腺炎(SAP),并确定功能基因模块 。利用机器学习方法对外周血细胞表达数据进行生物信息学分析,鉴定出急性胰腺炎外周血细胞中的两个功能基因模块,并鉴定出重症胰腺炎的预测因子。此外,通过对 COVID-19 患者scRNA-Seq联合bulk RNA-seq数据的组合分析,一种具有强干扰素相关途径激活的中性粒细胞的关键亚型被确定为 COVID-19 诱导的急性胰腺炎的关键外周血细胞亚型。       ………………………………

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