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PyMOL自动化插件更新介绍 建议电脑阅读。 PymolFold 最近结构预测的进展如火如荼，但是由于AF3系列模型都需要本地GPU跑Diffusion，因此一直没有更新。最近ESM-3在Science上见刊后大规模开放了ESM-3的API使用，因此更新了基于ESM-3的结构预测工具。 安装ESM与新版PymolFold插件，打开Pymol后在Pymol prompt中输入： pip install esm load http://cloudmol.org/pf_plugin.py 1. 配置ESM-C的access token，前往 https://forge.evolutionaryscale.ai/console 获取一个API token。 2. 把API token加入环境变量。 export ESM_API_TOKEN= 3. 使用方法。 esm3 # is the protein sequence. # is the name of the output pdb file. # is the temperature of the folding process. Default is 0.7. # is the number of steps in the folding process. Default is 8. # is the name of the model. Default is "esm3-medium-2024-08", [small, medium]. 细节参考： https://github.com/JinyuanSun/PymolFold ChatMol 最
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