J. Am. Chem. Soc. | 质谱法对tRNA进行从头测序及修饰定量

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大家好，今天分享一篇发表在JACS上的文章：Mass Spectrometry-Based Direct Sequencing of tRNAs De Novo and Quantitative Mapping of Multiple RNA Modifications，通讯作者是纽约理工学院的Shenglong Zhang教授，他们课题组主要研究RNA修饰的测序及其调控机制。本文作者开发了一种名为MLC-seq的基于质谱的tRNA从头测序手段，实现了对tRNA修饰的检测及修饰率定量。 高通量测序技术目前被广泛用于RNA的检测，但由于缺乏对多种RNA修饰通用的检测方法，因此在修饰丰富的tRNA上存在局限，并且对于一些部分修饰的位点，修饰率的确定也是测序方法面临的一大挑战。 质谱法通过化学或酶来将RNA降解为片段，进而通过这些片段来实现测序，理论上能够同时检测所有修饰类型，但由于片段在质谱检测时容易出现缺失，因此对样品量和纯净度等要求较高，难以应用在实际样品。本文作者通过开发 ………………………………